Християнізація якізів - це те, що дозволило релігійним віруючим поширитися в 1609 році, проникаючи на територію Сонори.
Під час колонії Сонора відповідала лише схилам Західної Сьєрри-Мадре, включеним до меж цієї сутності. Регіон, що пролягав на північ від річки Які, включаючи Реал-де-ла-Сьєнегілья, називався Пімерія Баха, а найпівнічніший регіон від цього Реалу до річки Колорадо - вже в нинішньому північноамериканському штаті Арізона - Пімерія Альта.
Нинішня територія Сонора також включає невеликий регіон на південному заході тогочасної Пімерії, розташований у штаті Чіуауа та Остімурі, місце, розташоване на узбережжі Каліфорнійської затоки, між річками Майо та Які.
У 1614 році місіонери Перес де Рівас і Педро Мендес християнізували майя в районі Остімурі, розділивши місію на три округи: Санта-Крус (в гирлі Майо), Навохоа і Тесія.
Тепахуе були об'єднані разом з Корнікарі в 1620 році. Отець Мігель Годінес заснував місії Сан-Андрес-де-Корнікарі та Асунсьйон-де-Тепахуї . Того ж року був заснований Ректорат Сан-Ігнасіо, який, крім п'яти згаданих місій, включав місії Бакум, Торін і Рахун, розташовані в гирлі Які.
У 1617 році якізи були навернені батьками Перес де Рівас і Томас Базіліо. Незважаючи на страждання від повстань, заворушень, мук і вбивств, перетворення Сонори було швидшим та безпечнішим. До 17 століття єзуїти розширилися і заснували місію Майкоби та Єкори в південно-західній частині того, що вони знали як Чініпа.
Місії від річки Які на північ були розділені на чотири сховища: місія Сан-Борха згрупувала місії: Кукумаріпа та Текоріпа , заснований у 1619 р .; Мовас та Оновас, у 1622 р .; Сахуаріпа в 1627 р .; Матапе 1629 р .; Онапа в 1677 р. Та Арівечі , в 1727 р. Ректорат трьох святих мучеників Японії, що включав Батуко, заснований в 1627 р., Опосуру в 1640 р. і Бакадегуачі , Гуазавас , Санта-Марія-Бачерака та Сан-Мігель Бавіспе , заснована в 1645 р. І ректорат Сан-Хав'єр, який інтегрував місії Уреса в 1636 р .; Акончі, Оподепе та Банамічі в 1639 р .; Кукурпе і Арізпе в 1648 р., І Куакіарачі в 1655 р.
У 1687 р. Місіонер Евсебіо Франциско Кіно увійшов до Пімерії Альта і розпочав місії ректората Нуестра Сеньора де лос Долорес, заснувавши: Каборку, до якої був призначений Франциско Хав'єр Саета, який веде листування при його духовній підтримці, батько Кіно; Атіл, Тубутама, Богоматір Скорботної де Сарік, Пітікіто, Айіл, Окітоа, Магдалена, Сан-Ігнасіо, Кокоспера та Імуріс.
Після вигнання єзуїтів місіями керували францисканці, які більше не будували, а обмежились лише спробами збереження існуючих. Коли єзуїти вже заснували поселення в Сіналоа та Сонорі, вони звернули свої погляди на каліфорнійську територію.
