Оскільки вони не знали, як далеко простягається північ країни, єзуїти прибули до Чіуауа. У XVII столітті нинішній штат був сформований у його південно-західній частині тим, що було відомо як регіон Чініпас, тоді як решта території була розділена між верхньою та нижньою Тарахумарою.
Перші спроби євангелізації чихуахуа відбулися під час поїздок єзуїтів, раніше поселених у штаті Синалоа. Першою в регіоні була побудована та, яку збудував отець Хуан Кастіні в 1621 році і відома як місія Чініпас.
Єзуїти працювали в горах серед індіанців Тепехуан, Гуазапарас і Тарахумара, тоді як францисканці працювали в долинах і рівнинах. Першим стабільним місіонером у регіоні Чініпас був отець-єзуїт Хуліо Паскуаль, замучений у 1632 р. Разом з отцем Мануелем Мартінесом. До 1680 року Фрай Хуан Марія Сальват'єра дав енергійний імпульс місії, яка була закріплена в 1690 і 1730 роках. У середині XVII століття єзуїтські місії в регіоні Чініпас стали одними з найкраще організованих і прогресивних.
На південь знаходився Набогаме, де ви все ще можете побачити церкву, курат і будинок місії, побудовані отцем Мігелем Війцем у 1744 році. Баборігаме Сатево знаходиться в тому ж районі, який набрав нових сил завдяки адміністрації отця Луїса Мартіна. і Тубарес, заснований в 1699 році отцем Мануелем Ордасом і відроджений адміністрацією історика Фелікса Себастьяна. Останній вважався одним із найзаможніших у церкві, будинку, худобі та ранчо. У центрі місії Церокахуї, Гуазапареш, Чініпас, Санта-Ана, а на півночі Бабарокос і Моріс.
Вперше район Тарахумара-Баха був євангелізований отцем Хуаном Фонте, який здійснив свій перший вхід у 1608 році. У 1639 році отець Херонімо Фігероа побудував місію Сан-Пабло-Бальєса та місію Уехотітана (Сан-Єронімо), тоді як отець Хосе Паскуаль будував Сан-Феліпе. У межах того ж регіону Тарахумара також знаходяться Ла-Джоя, Санта-Марія-де-лас-Куевас і Сан-Хав'єр Савето, остання місія побудована в 1640 році отцем Віргіліо Маесом.
Щодо території Альта Тарахумара, яка охоплювала центр та північ цього утворення, євангелізаційну роботу розпочали отці Тара, Гвадалахара, Челада, Таркай та Нейман. Місії, включені в цей регіон, були: Тоначі, Норогачі, Нонова, Нарачі, Сісогічі, Карічі, Сан-Борха, Темечі або Темейчі, Коячі або Коячі, Томочі або Томочі, Тутуака або Тутуата, Папігочі, Санто-Томас, Матачі. У середині XVII століття єзуїтська місія в Чіуауа стала найкраще організованою і керованою, за винятком тих, що були в Каліфорнії.
На території чихуахуанів існувала також місіонерська діяльність францисканців. Метою релігійних було завершити зв’язок, який вже існував на півночі Сакатеки, для чого вони заснували монастирі в Чіуауа та Дуранго. Монастирі, як і єзуїти, мали виконати мету євангелізації невірних. Будували будівлі Нуестра-Сеньора-дель-Норте, яка зараз є Сьюдад-Хуарес, Сан-Буенавентура-де-Атотонілко (Вілла Лопес), Сантьяго Бабонояба, Паррал, Санта-Ізабель-де-Тарахумара, Сан-Педро-де-лос-Кончос, Бачініва чи Басінава (Нуестра-Сеньора-де-Натівід ), Намікіпа (Сан-Педро-Алькантара), Карретас (Санта-Марія-де-Грасія), Хулімес, Сан-Андрес, Номбре-де-Діос, Сан-Феліпе-ель-Реаль-де-Чіуауа та Касас-Грандес.
