Побудована на схилах пагорбів, міська структура цього міста повинна була адаптуватися до топографічних аспектів рельєфу, хоча намагалася поважати сітчасту форму, як шахова дошка.
Цей аспект у довгостроковій перспективі дозволив йому рости розмірено і гармонійно, що протягом століть зберігало свій первісний характер. Її основа виникла з необхідності захищати та охороняти мандрівників, які проїжджали транзитом між Сакатекасом та столицею тодішнього королівства Нова Іспанія, перевозячи переважно корисні копалини та які опинилися в облозі корінних кочівників нації Чічімека. Сан-Мігель заснував в околицях нинішнього міста місто з ім'ям Іцкуінапан, присвятивши Архангела Сан-Мігеля святим покровителем. Це первісне населення мало серйозні проблеми з водопостачанням, на додаток до безперервних і жорстоких нападів корінних чичимек навколишніх регіонів. З цієї причини жителі Вілли де Сан-Мігель перенесли поселення на кілька кілометрів на північний схід; Це було місце, де у 1555 р. На прохання віце-короля дона Луїса де Веласко Вілла де Сан-Мігель-ель-Гранде була б заснована доном Анхелем де Віллафаньє. Віце-король також вимагав, щоб там оселилися іспанські сусіди, яким буде надано землю та худобу, тоді як корінним жителям, які проживали в ній, буде прощена данина та керуватимуть власні начальники, щоб уникнути майбутніх заколотів.
8 березня 1826 р. Державний конгрес зробив його містом і змінив назву, яка відтепер стане Сан-Мігелем де Альєнде, на честь відомого повстанця, який народився там у 1779 р.
Усередині цього привабливого колоніального образу розміщено кілька справді чудових палаців того часу. Серед найвидатніших - Муніципальний палац, колишня ратуша, побудована в 1736 році. Будинок, де народився Ігнасіо Альєнде, є прикладом барокової архітектури міста, особливо на його фасаді, і який зараз є Регіональним музеєм. Канал дель Майоразго-де-ла-Канал з прекрасним неокласичним фасадом був добудований наприкінці 18 століття Хосе Маріано де ла Каналом і Гервасом, олдерменом, деканом та королівським прапорщиком. Старий садибний будинок дона Мануеля Т. де ла Канала, споруда 1735 р., Відремонтована за проектом видатного іспанського архітектора дона Мануеля Толса в 1809 р .; в даний час в будівлі знаходиться Інститут Альєнде, і він підкреслює широту внутрішніх двориків, прекрасну каплицю та надзвичайні арки. Будинок інквізитора, який служив резиденцією уповноваженого Священної канцелярії і який датується 1780 р. Будинок Маркеса де Жарала де Берріо, побудований наприкінці 18 століття, та будинок графів Лоха з його елегантним фасадом.
Що стосується релігійної архітектури, місто також може похвалитися архітектурними скарбами надзвичайної цінності, такими як церква та монастир Санто-Домінго, твереза будівля 1737 року. Монастир Леаль де ла Консепсьйон, який в даний час є культурним центром, Це чудова будівля завдяки своєму величезному внутрішньому дворику; Він був побудований у 18 столітті архітектором Франциско Мартінес Гудньо.
Каплиця Санта-Крус-дель-Чорро, одна з найстаріших; храм Третього Чину, датований початком XVII ст. Прекрасний комплекс храму та ораторії Сан-Феліпе Нері з початку 18 століття; церква має пишний бароковий фасад, виконаний у рожевому кар'єрі та прикрашений сильним корінним впливом. Його інтер'єр має різноманітне і багате оздоблення меблів, скульптур та картин, що заслуговують на захоплення, на додаток до чудової каплиці Санта-Каса-де-Лорето та Камаріна-де-ла-Вірген, які вишукано прикрашені, і завдяки відданості маркіза Мануеля Томас де ла Канал. Поруч з ораторієм знаходиться храм Богоматері Здоров'я, побудований у 18 столітті із заглибленим фасадом, увінчаним великою раковиною.
Також серед найпривабливіших у місті є храм Сан-Франциско 18 століття з прекрасним фасадом Чуррігереска, а знаменита парафія є майже символом Сан-Мігель-де-Альєнде; Незважаючи на те, що його будівництво в стилі неоготики є недавнім, воно було побудоване на структурі старого храму 17 століття, повністю поважаючи його інтер’єр та оригінальний план.
Зовсім недалеко від міста знаходиться святилище Атотонілько, споруда 13 століття тверезих розмірів, схожа на фортецю, всередині якої збереглися цінні картини того ж століття.
